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2018年底衛福部食藥署正式發布規定:糞腸球菌(Enterococcus faecalis)和屎腸球菌(Enterococcus faecium)兩款菌種,未經確認其食用安全性前,不得作為食品原料使用。

腸球菌的爭議其實已經存在許久,過去曾被歸類為益生菌的糞腸球菌及屎腸球菌,經過研究發現,其帶有抗藥性基因可能演變成超級細菌,且近年來抗生素濫用、錯用的問題層出不窮,腸球菌造成感染的風險也越來越大。

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