全國醫師聯合會所提供政府指示的內部應變重點如下：

一、政府放棄清零進入減災階段的政策，也就是正常生活與病毒共存。

二、台灣因前一階段防疫成果優良強度很高，故現階段用此政策將會使疫情曲線拉長，由別的國家兩三個月會拉長到五六個月。

三、目前開始多點爆發，兒童也無法避免，除呼吸道症狀、尚有發燒、腸胃症狀、腹瀉嘔吐。

四、政府確定用減災共存政策，故將來干預會減少，疫調會簡化，停班停課會盡量避免，若有輕症感染者迅速診斷並給藥，在家隔離。

五、在減災階段與病毒共存，公衞疫調手段逐步退場，準備只用醫療處理，輕症就當作流感、感冒迅速診所就醫並在家隔離模式處理，不再用公衛疫調隔離模式。輕症轉重症才由大醫院處理，以避免醫療量能不足。