臨床與研究中都曾在新冠患者的排便中檢測到病毒，甚至根據史丹佛大學的研究，有12.7％的患者在4個月後腸胃道中還存在新冠病毒。

有33％～54％的成人發病後在2～5周可從糞便發現病毒，因此如果浴廁共用，馬桶需要用漂白水消毒。

新冠病毒藏在腸胃道中的患者大約僅有4～5％，儘管比例不高，然而腸胃道中驗到病毒的時間將可長達7個月之久。

多攝取膳食纖維後，腸道菌可利用纖維發酵產生能帶給腸道益處的短鏈脂肪酸，益處包括：修復腸道黏膜、減少害菌的傷害，活化免疫細胞、提升免疫力等。

優格、泡菜、味噌、酸菜等發酵食物中含有多種好菌與細菌的代謝物，不僅對呼吸道系統的免疫反應有益，還可縮短感染的時間。

染疫後除了服藥儘量排除病毒以外，服用人類腸道益生菌也是讓腸道免疫復原的重要方法之一。